益生菌不仅有助于缓解腹泻，中华预防医学会发布的《益生菌儿科临床应用循证指南》指出，它还能减少呼吸道感染发生次数、发热时间和咳嗽等。
反复呼吸道感染是小儿常见的临床现象，免疫力低下、营养不良、患基础疾病、护理不当、滥用药物等都可能致病。如果孩子有呼吸道感染问题，可在医生指导下服用益生菌，以提高胃肠道、呼吸道、泌尿生殖道黏膜的免疫力，减少痰多、咳嗽等。
目前我国使用的益生菌有20多种，预防反复呼吸道感染，推荐口服酪酸梭菌活菌散、酪酸梭菌二联活菌散和双歧杆菌三联活菌散。由于每个孩子肠道菌群紊乱的程度不同，所以使用同样剂量的同一种药物效果可能不同，因此要遵医嘱用药。
给孩子使用益生菌时要注意：部分益生菌辅剂中含有牛奶，不耐受的患儿可能过敏。益生菌为活的微生物，应避免与抗生素同时服用。有些益生菌制剂需要低温（2℃至8℃）保存。服用时，水温以35℃至40℃为宜，冲调水量不超过80毫升，冲泡后尽量在半小时内服用。饭后胃酸浓度降低，更有利于活菌顺利到达肠道发挥作用，所以饭后20分钟服用较好。
